母猪流产后体温40℃是一个需要关注的情况。以下是一些建议的处理方法：

及时清洗子宫：

流产后，母猪的子宫需要及时清洗以减少感染的风险。

打消炎针：

为了消炎彻底，可以给母猪注射抗生素，如观林先锋和磺胺类药物。

退烧治疗：

母猪体温40℃属于高烧，可以使用退烧针进行治疗。同时，保持猪舍干燥、温暖和良好的通风，有助于病情缓解。

观察饮食情况：

母猪流产后食欲不振是常见现象，但长时间不吃需要特别关注，可能需要通过灌服或静脉注射补充营养和水分。

查找发烧原因：

母猪发烧可能有多种原因，如饲喂生粉料、饮用凉水、温度下降、误食有毒饲料或感染病原体等。需要仔细检查环境和饲料，找出具体原因并进行针对性治疗。

寻求专业帮助：

如果母猪的病情持续不改善，建议及时联系兽医进行详细检查和治疗，以确保母猪的健康。

希望这些建议能帮助你更好地处理母猪流产后的发烧情况。