农村养殖申请建房的流程如下：

了解政策与规划

向当地的国土部门、农业部门或乡镇政府了解所在区域的养殖规划、禁养区、限养区等相关信息，确保所选地址符合规定。

具体标准因畜种而异，例如生猪年出栏量500头以上，蛋鸡、蛋鸭存栏量2000只以上，肉鸡、肉鸭年出栏量10000只以上，奶牛存栏量100头以上，羊年出栏量200只以上等。

初步选址

根据了解到的信息，选择合适的土地作为养殖场的建设地点。

尽量选择地势较高、排水良好、通风透气、远离居民区且交通相对便利的地方，同时要考虑水、电等基础设施的接入条件。

办理相关手续

土地手续：

签订土地流转合同：如果所选土地不是自己的承包地，需要与土地所有者（一般是村集体）签订土地流转合同，明确土地的使用期限、用途、租金等事项。

申请设施农用地备案：向乡镇政府的相关部门提交设施农用地备案申请，同时提供土地流转合同、养殖场的建设方案（包括平面图、布局图等）等材料。乡镇政府会对申请进行审核，审核通过后报县级国土部门备案。

办理农业用地转建设用地审批（如有必要）：如果养殖场建设需要建设永久性建筑，如办公用房、饲料仓库等，且占用的土地属于非设施农用地范畴，那么需要办理农业用地转建设用地的审批手续，并缴纳相应的使用费和造地费。

养殖项目申请：

以养殖公司的名义，向村委会申请，报上级有关部门批准。

拟申请地块如属农用地，必须先办理农用地转用手续，如村民小组不同意使用该地块，需征得村民代表大会通过，方可申请，后报建设、环保、林业、土地等部门批准。

向畜牧管理部门申请养殖项目。

如果是建种畜场还要申请良种繁殖许可证。

提交申请材料

申请人持申请材料向当地村委会提出书面用地申请。

村委会应当在每一个季度集中申请材料，依法召开村委会或村民代表大会进行审议，并张榜公布，在张榜公布之日起15个工作日内本村村民未提出异议或者异议不成立的，上报给乡镇国土资源所初审。

现场勘查与审核

乡（镇）人民政府组织国土资源所进行现场勘查和群众调查，审查建房用地和建设申请条件，并制作勘查笔录和审查意见书。

国土资源所初审合格后发放《农村村民住宅用地与建设申请表》。

村委会对申请人提交的《农村村民住宅用地与建设申请表》进行审查并签署意见，证明申请人的原住宅用地情况和家庭成员现居住情况，由负责人签字，同时加盖村民委员会公章，报乡（镇）人民政府审核。

审批与放样

乡（镇）人民政府在收到村委会上报的住宅建设用地申请材料后完成审核并现场确定规划用地范围，并报县国土资源局初审。县国土资源局对符合审批条件的上报县人民政府。

县人民政府批准用地的，由县国土资源局颁发《建设用地批准书》。

由国土资源所牵头协同乡镇政府人员根据《建设用地批准书》和《村镇建设工程规划许可证》到实地放样，划定范围，填写《放样记录卡》，放样参加人应当在《放样记录卡》上签字。放样后，用地申请人方能动工建设。

验收与发证

新建、改建、扩建农村村民住宅，应当自房屋竣工验收合格之日起30个工作日内依法申请办理土地初始登记或者变更登记手续和房屋产权登记手续，领取土地使用权证书和房屋所有权证书。

建议：

在申请过程中，确保所有手续和材料齐全，并严格按照当地政策和法律法规进行申请。

与当地政府和相关部门保持良好沟通，及时解决申请过程中遇到的问题。