笼养肉鸡温控的弊端主要包括以下几点：

成活率受影响：

过低的温度会导致鸡群出现冷应激和料比升高，特别是在养殖周期的20-33天之间，问题尤为明显，从而影响成活率。

温度管理复杂：

整个养殖周期的温度曲线需要根据外界环境和鸡群状况进行调整，每日目标温度的检查不可忽视。管理者需要根据鸡群表现做出适应性的调整，这增加了养殖管理的复杂性。

温度不均匀：

笼养肉鸡由于鸡舍的长度和笼体的空间性，存在温差是必然的。若管理不当，可能导致鸡群受凉或过热，影响生长和健康。

热应激问题：

夏季高温环境下，鸡群容易受到热应激，导致采食量下降，影响后期增重和经济效益。热应激还会对鸡群造成身体损伤，严重时甚至导致死亡。

通风问题：

通风不足或不合理会导致鸡舍内温度和湿度不均，增加疾病发生率。例如，风速小或有通风死角会导致体感温度偏高，影响鸡群健康。

设备投资大：

笼养鸡需要大量设备投入，包括温控系统、风机等，增加了养殖成本。

应激反应：

适当的应激有助于鸡群适应环境，但过度的或不适当的热应激会对鸡群造成负面影响，如降低采食量和增加死亡率。

疾病发生率高：

不均匀的温度分布和通风不良会导致鸡只生长不均，疾病发生率增加，甚至死亡。

综上所述，笼养肉鸡在温控方面存在诸多弊端，需要管理者在实际操作中注重温度的合理控制和调整，以提高鸡群的成活率和生长性能。