肉鸡患有肠毒综合症时，主要表现为 拉料便，粪便中含有没消化好的饲料，采食量明显下降，生长缓慢或体重减轻，脱水和饲料报酬下降。由于肠的蠕动加快加强，胆囊分泌的胆汁迅速从肠道排出，与没消化的饲料混合在一起，形成该病的特征性粪便——略带浅黄色的粪便。此外，病鸡可能会出现精神异常兴奋、头颈震颤、乱跑乱撞、尖叫等症状，兴奋不安后往往因瘫软、衰竭而死亡，且黎明前猝死现象明显增多。剖检早期病例可见，患鸡十二指肠、空肠肠壁肿胀，肠黏膜增厚，颜色变浅，呈灰白色，像一层厚厚的麸皮，极易剥离，小肠的浆膜表面有针尖至绿豆粒大小的红色出血点；剖检死亡鸡只可发现肠壁变薄，黏膜脱落，肠内容物有的呈脓样、有的呈鱼肠子样，有的呈西红柿样。综合临床症状与病理变化，可初步诊断为肉鸡肠毒综合征，确诊需进行实验室诊断。