秸秆养牛养羊是否违法，需要根据具体情况来判断：

散养或圈养且数量较少：

如果不属于规模型的养牛或养羊，只是家庭数量较少的散养或者圈养，法律对此不作要求，因此不违法。

规模型养殖场：

如果养牛或养羊数量达到一定规模，属于养殖场性质，则需要先办理环评手续并报环保局审批后才能经营。此外，还需要办理营业执照和《动物防疫合格证》，如果有深加工项目，则同时需要办理相应的许可证。

基本农田保护：

我国法律严格保护基本农田，控制非农业建设占用农用地。农村自家院子不属于农田，因此养羊不属于占用农用地，即合法。

环保政策：

在农村，农民养羊都是散养的，只要总数不超过150头，就符合国家相关环保政策。

建议

如果您的养牛或养羊数量较少，且为散养或圈养，则一般不违法，无需特别办理手续。

如果您的养牛或养羊数量较多，达到规模型养殖场的标准，建议先了解并遵守相关环保和动物防疫规定，办理必要的手续。

以上信息仅供参考，具体情况可能因地区和具体政策执行而异，建议咨询当地相关部门获取最准确的信息。