治疗鸡坏死性肠炎可以使用以下药物：
抗生素类药物阿莫西林：适用于细菌感染引发的鸡坏死性肠炎，通过抑制细菌细胞壁合成而发挥杀菌作用。使用时需监测肝肾功能，避免与其他药物相互作用，并遵循医嘱调整剂量。
头孢噻呋：主要针对由革兰氏阳性菌和阴性菌引起的鸡坏死性肠炎，能有效穿透细胞膜并破坏细菌细胞壁。使用期间应注意观察可能出现的过敏反应，并按推荐剂量进行静脉注射。
氟苯哒唑：用于治疗鸡的寄生虫感染，如蛔虫、鞭虫等，具有广谱抗寄生虫作用。使用时需注意剂量控制和长期使用可能引起的耐药性问题。
氯氰菊酯：可作为杀灭鸡舍内害虫的农药，对多种昆虫有高度毒性，但对禽畜有毒，因此不能直接用于鸡体。使用时应严格遵守施药浓度和用量，确保人员穿戴防护装备，并保持通风良好。
庆大霉素：与甲硝唑配合使用，庆大霉素按每千克体重1.5万单位/次，每天早晚各一次；甲硝唑按0.1%比例混饲或按0.05%浓度饮用，连用4~5天。
氧氟沙星、 林可霉素和 磺胺类药物也是常用的抗生素，用于治疗鸡坏死性肠炎。
抗寄生虫药物弗吉尼亚霉素、 泰乐菌素、 林肯霉素等对本病具有良好的治疗和预防作用，一般通过饮水或混饲给药。
东方肠康：含有活性菌和进口止痢因子，调节肠道菌群平衡，修复肠道黏膜，快速止泻，适用于禽敏感的革兰氏阴性菌所致的胃肠道感染。
利康剑客：富含清热燥湿、止血止痢、升阳举陷类中药，有效防治各种因素所致的粪便异常及肠道出血，修复肠粘膜，消除肠道溃疡。
妙效肠安、 益肠安、 氨苄青霉素：这些中药制剂可用于增强鸡群的免疫力，预防肠道疾病的发生，并与抗生素联合使用以增强治疗效果。
其他辅助药物甲硝唑：与庆大霉素配合使用，用于治疗鸡坏死性肠炎。
癸氧喹酯溶液：用于治疗小肠球虫与坏死性肠炎的合并感染。
霉菌治疗药：用于治疗霉菌肠炎与坏死性肠炎的合并感染。
综合治疗：根据鸡坏死性肠炎的严重程度、鸡的年龄、免疫状况等因素，制定合理的治疗方案，通常需要综合使用抗生素、抗寄生虫药物和中药制剂。
环境控制：改善鸡舍环境条件，及时清除粪便和通风换气，减少有害菌滋生。
饲养管理：加强饲养管理，合理储藏动物性蛋白质饲料，防止有害菌的大量繁殖，并建立严格的消毒制度。
在使用任何药物之前，建议先进行药敏试验，以选择高敏药物进行治疗，确保治疗效果并减少耐药性的产生。同时，严格遵守药物使用说明和兽医的建议，确保用药安全。
