不让跨省运猪的原因主要有以下几点：

防止疫情扩散：

跨省运猪可能会导致疫情的传播和扩散。例如，在非洲猪瘟疫情爆发期间，为了切断病毒传播链条，农业农村部宣布暂停了多个省份的生猪跨省调运。

保护当地养殖户利益：

一些省份为了保护当地养殖户的利益，防止猪肉价格下跌导致养殖减产，实施了跨省禁运措施。

减少环保要求：

跨省运猪可能会降低环保要求，不利于小型养殖户的复养。

防止价格差异带来的非法调运：

价格差异可能导致非法跨省调运，以获取暴利。禁止跨省运猪可以减少这种利益驱动。

便于管理和监控：

禁止跨省运猪有助于便于政府和相关部门进行管理和监控，确保生猪产品的安全和质量。

综上所述，不让跨省运猪主要是为了控制疫情传播、保护当地养殖户利益、减少环保要求、防止非法调运以及便于管理和监控。